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南京中醫(yī)藥大學始建于1954年，歷經(jīng)江蘇省中醫(yī)進修學校、江蘇省中醫(yī)學校、南京中醫(yī)學院、江蘇新醫(yī)學院、南京中醫(yī)學院等歷史時期，是全國建校最早的中醫(yī)藥高等院校之一，是江蘇省重點建設(shè)高校，也是江蘇省人民政府與國家中醫(yī)藥管理局共建高校。建校60多年來，南京中醫(yī)藥大學為新中國高等中醫(yī)教育培養(yǎng)輸送了第一批師資、主持編寫了第一套教材和教學大綱，培養(yǎng)了新中國中醫(yī)藥界最早的學部委員，為新中國中醫(yī)高等教育模式的確立和推廣做出了重要貢獻，被譽為“中國高等中醫(yī)教育的搖籃”。

學校坐落于鐘靈毓秀、虎踞龍蟠的古都南京，擁有仙林和漢中門兩個校區(qū)?，F(xiàn)有各類在校生近2萬名，設(shè)有基礎(chǔ)醫(yī)學院、第一臨床醫(yī)學院、第二臨床醫(yī)學院、醫(yī)學與生命科學學院、藥學院、衛(wèi)生經(jīng)濟管理學院、護理學院、外國語學院、信息技術(shù)學院、心理學院共10所直屬學院，28個本科專業(yè)，涉及醫(yī)、管、理、工、經(jīng)、文等6個學科門類，初步形成了以中醫(yī)藥為主體、中西醫(yī)結(jié)合、多學科為支撐協(xié)調(diào)發(fā)展的辦學格局。

學校是世界衛(wèi)生組織(WHO)傳統(tǒng)醫(yī)學合作中心、國家衛(wèi)生部確定的國際針灸培訓中心、全國中醫(yī)師資進修教育基地、中國中醫(yī)藥文獻信息檢索中心南京分中心，同時也是首批獲國家教育部批準接受和培養(yǎng)外國留學生及臺港澳地區(qū)學生的高等中醫(yī)藥院校。2010年6月20日，學校與澳大利亞皇家墨爾本理工大學合作建立了全球首家中醫(yī)孔子學院，時任國家副主席習近平出席了揭牌儀式并發(fā)表重要講話。學校目前與世界90多個國家和地區(qū)有著廣泛交流和聯(lián)系，并與世界30多個國家和地區(qū)的政府、高等院?；?qū)W術(shù)團體及機構(gòu)建立了友好合作關(guān)系，具有較高的國際聲譽和影響力。

面向未來，南京中醫(yī)藥大學將進一步繼承和發(fā)揚辦學的優(yōu)良傳統(tǒng)和作風，不斷深化體制機制改革，大力實施“人才強校、質(zhì)量興校”戰(zhàn)略，加強內(nèi)涵建設(shè)，提升辦學水平，通過辦學規(guī)模、結(jié)構(gòu)、質(zhì)量、效益的協(xié)調(diào)發(fā)展，積極創(chuàng)建“國際著名、國內(nèi)一流”的中醫(yī)藥大學，努力躋身于全國具有鮮明特色的高水平大學行列。